Скачал с сайта MS Windows Embedded 7, чтобы попробовать.
Чтобы Windows 7 загружалась с USB 3.0, нужны какие-то особые драйвера?
Загружается, показывает картинку-логотип Windows и вылетает в синий экран.
Переставляю эту же флешку в соседний порт USB 2, загружается и нормально работает.
Железо такое:
Флеш-накопитель USB 3.0 Transcend JetFlash 780 16Gb (TS16GJF780)
Материнская плата GigaByte GA-Z68MA-D2H-B3, Socket1155, iZ68, 4DDRIII, 2PCI-Ex16, SATAIII RAID, GLAN, USB 3.0, DVI, mATX, Retail
Процессор Intel Celeron G540 2500MHz 2Mb S1155 tray
Установил все драйвера с прилагаемого к мат.плате диска, обновил Windows из интернета. биос последней версии.
Загрузился с usb 2. Вставил в usb 3 другую флешку, драйвера подгрузились, флешку видно, т.е. порт usb 3 рабочий.
Установил Windows на флешку с интерфейсом usb 2, она так же вылетает в синий экран если вставлена в порт usb 3.